Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms