Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NMNAT3Q96T66 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NMNAT3Q96T66 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms