Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CICQ96RK0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CICQ96RK0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms