Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
YTHDC1Q96MU7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms