Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q96MF0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q96MF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q96MF0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q96MF0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q96MF0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q96MF0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q96MF0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q96MF0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q96MF0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Q96MF0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q96MF0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q96MF0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q96MF0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q96MF0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q96MF0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms