Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms