Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM71F1Q96KD3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM71F1Q96KD3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms