Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDLIM2Q96JY6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms