Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A4AQ96JQ5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A4AQ96JQ5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms