Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
LRRIQ1Q96JM4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRIQ1Q96JM4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRIQ1Q96JM4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms