Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EAF1Q96JC9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EAF1Q96JC9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EAF1Q96JC9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EAF1Q96JC9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EAF1Q96JC9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EAF1Q96JC9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EAF1Q96JC9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EAF1Q96JC9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EAF1Q96JC9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EAF1Q96JC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms