Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RAX2Q96IS3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms