Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms