Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RNFT2Q96EX2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms