Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC10A4Q96EP9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A4Q96EP9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms