Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C18orf8Q96DM3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C18orf8Q96DM3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms