Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCTD12Q96CX2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCTD12Q96CX2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms