Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms