Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCE1Q969G3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMARCE1Q969G3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms