Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNRQ92752 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNRQ92752 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNRQ92752 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNRQ92752 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TNRQ92752 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNRQ92752 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNRQ92752 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNRQ92752 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNRQ92752 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms