Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
TOPBP1Q92547 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TOPBP1Q92547 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms