Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC4DQ8WXI8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLEC4DQ8WXI8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms