Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3RF3Q8TEJ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3RF3Q8TEJ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms