Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SSH3Q8TE77 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms