Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACER1Q8TDN7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACER1Q8TDN7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms