Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNNM3Q8NE01 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms