Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APCDD1LQ8NCL9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APCDD1LQ8NCL9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms