Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSIP1Q8NA03 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSIP1Q8NA03 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms