Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZIC4Q8N9L1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC4Q8N9L1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms