Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL6Q8N841 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTLL6Q8N841 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms