Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM2Q8N271 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROM2Q8N271 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms