Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC2Q8N158 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC2Q8N158 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC2Q8N158 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC2Q8N158 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC2Q8N158 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms