Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG10Q8N0Z9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG10Q8N0Z9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG10Q8N0Z9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG10Q8N0Z9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG10Q8N0Z9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG10Q8N0Z9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG10Q8N0Z9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG10Q8N0Z9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms