Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y2

ZNF444, Zinc finger protein 444, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444Q8N0Y2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF444Q8N0Y2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF444Q8N0Y2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms