Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2LQ8IYA6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms