Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNTD2Q8IXW0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNTD2Q8IXW0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNTD2Q8IXW0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNTD2Q8IXW0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LMNTD2Q8IXW0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms