Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RASSF3Q86WH2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF3Q86WH2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms