Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT25Q7Z3Z0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms