Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf139Q6ZV77 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms