Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBR3Q6ZT12 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
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