Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCAPQ6ZRS2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCAPQ6ZRS2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms