Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00322Q6ZN03 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms