Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATRAIDQ6UW56 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms