Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZCCHC12Q6PEW1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms