Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RCSD1Q6JBY9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCSD1Q6JBY9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms