Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNS3Q68CZ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNS3Q68CZ2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
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