Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C9orf135Q5VTT2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms