Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF38BQ5VTL8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms