Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RIF1Q5UIP0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIF1Q5UIP0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms