Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BEND3Q5T5X7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms